RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nr1d1Q3UV55 615 aa22.77■■□□□ 1.24
Syde2-201ENSMUST00000039517 C87499Q3UX49 493 aa22.77■■□□□ 1.24
Syde2-201ENSMUST00000039517 GlyctkQ8QZY2 523 aa22.77■■□□□ 1.24
Syde2-201ENSMUST00000039517 Prkg1P0C605 671 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tshz1Q5DTH5 1084 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 GancQ8BVW0 898 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fermt3Q8K1B8 665 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrc8cQ8R502 803 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppfia4B8QI36 1187 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sval3Q76I99 144 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rcor2Q8C796 523 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Smc6Q924W5 1097 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Emilin1Q99K41 1017 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Krt74Q6IFZ9 495 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tfap4Q9JIZ5 338 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmem191cQ9JJB1 302 aa22.76■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Calb1P12658 261 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gpr182P43142 395 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf207Q3V3A7 635 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kctd10Q922M3 315 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Col1a2Q01149 1372 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Surf1P09925 306 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 LdhbP16125 334 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Iqsec3Q3TES0 1195 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc8a1P70414 970 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf219Q6IQX8 726 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Erp44Q9D1Q6 406 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Strn3Q9ERG2 796 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mknk2Q8CDB0 459 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 IdeQ9JHR7 1019 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Eef2kO08796 724 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kctd16Q5DTY9 427 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cabs1Q8C633 391 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pstpip2Q99M15 334 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa22.75■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Map3k4O08648 1597 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gna14P30677 355 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam178bQ24JP3 464 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rint1Q8BZ36 792 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tsc1Q9EP53 1161 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dnajb7Q9QYI8 312 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Copb2O55029 905 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nr2f2P43135 414 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 MgarpQ8VI64 283 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp6v1e2Q9D593 226 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pgrmc1O55022 195 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kiaa1468Q148V7 1216 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nacc1Q7TSZ8 514 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kat14Q8CID0 779 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sdr42e1Q9D665 394 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cnga4Q3UW12 575 aa22.74■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp1b3P97370 278 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 SpertQ32MG2 446 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Islr2Q5RKR3 745 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp26b1Q811W2 512 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vmn1r199Q8R280 367 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hps3Q91VB4 1002 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ror2Q9Z138 944 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Stk39Q9Z1W9 556 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 NsfP46460 744 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc68Q8BVC4 333 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Abcc12Q80WJ6 1366 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 4932429P05RikA2ADI4 785 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ptpn14Q62130 1189 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pde6aP27664 859 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mum1l1Q4VA55 681 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ankrd6Q69ZU8 712 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 PigbQ9JJQ0 542 aa22.73■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mdh1P14152 334 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cep70Q6IQY5 616 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Adamts12Q811B3 1600 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kcnb2A6H8H5 907 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Efcc1Q9JJF6 558 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Glt1d1A4FUP9 346 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ric8aQ3TIR3 530 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cep104Q80V31 926 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Adarb2Q9JI20 745 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 E330017A01RikQ8BU47 192 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Eno4Q8C042 619 aa22.72■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf532Q6NXK2 1036 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cdc37Q61081 379 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrc41Q8K1C9 807 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms