RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	MGR1	P25573	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	NUP133	P36161	1157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SOL4	P53315	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	RSM23	Q01163	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	VPS72	Q03388	795 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YEH1	Q07804	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	CTI6	Q08923	506 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MED1	Q12321	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SGS1	P35187	1447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YCR043C	P25361	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	BOS1	P25385	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	GID7	P25569	745 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YKL100C	P34248	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ICS2	P38284	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	EFM2	P38347	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YIL169C	P40442	995 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	NUP100	Q02629	959 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SRL1	Q08673	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	BUD7	Q08754	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YPT6	Q99260	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YBR144C	P34215	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	UBP11	P36026	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MET30	P39014	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MAF1	P41910	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	VID30	P53076	958 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	VPS75	P53853	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	RSF1	Q05043	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	GCN4	P03069	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	CBS1	P14066	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	PEP3	P27801	918 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	REG2	P38232	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YBR225W	P38321	900 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	RGI2	P40188	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	FET5	P43561	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	TIM10	P87108	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	NUP53	Q03790	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	COG4	Q06096	861 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	RPN12	P32496	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ROT2	P38138	954 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ERG7	P38604	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SMA1	Q02651	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MSC1	Q03104	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MFB1	Q04922	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SDH5	Q08230	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	BSC1	Q12140	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MRP13	P12686	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SEF1	P34228	1148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	PHD1	P36093	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	SRO77	P38163	1010 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	NPR2	P39923	615 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	DUG3	P53871	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	IPI3	P53877	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	FMP42	Q04991	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	HNM1	P19807	563 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	RAD24	P32641	659 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	RKM3	P38222	552 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	LAG1	P38703	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	CIN4	P39110	191 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	ALG5	P40350	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SPO20	YMR017W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	YGR066C	P53242	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	SSK1	Q07084	712 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	MRP7	P12687	371 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	OCA4	P25366	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	SNC1	P31109	117 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	ERP2	P39704	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	YND1	P40009	630 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	NDE1	P40215	560 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	RMD8	P43620	662 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO20	YMR017W	YGR126W	P53274	230 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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