RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KLRK1	P26718	216 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM14	Q14142	442 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXP2	O15409	715 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	DNM2	P50570	870 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1I3	Q14994	352 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC16A2	P36021	539 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RASSF7	Q02833	373 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GSTO1	P78417	241 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ALX1	Q15699	326 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A087X0B3	334 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF185	O15231	689 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GYPC	P04921	128 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PIGS	Q96S52	555 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CHMP2A	O43633	222 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	IVL	P07476	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FCER1A	P12319	257 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SCNN1D	P51172	638 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	VAV2	P52735	878 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	DDAH1	O94760	285 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MOCS3	O95396	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KLK7	P49862	253 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF2I	P78347	998 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	USH1G	Q495M9	461 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GTH6	734 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	EBAG9	O00559	213 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF40	O75150	1001 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	BTD	P43251	543 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MNAT1	P51948	309 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	GJA10	Q969M2	543 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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