RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 BADQ92934 168 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 GUCD1Q96NT3 240 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FEM1BQ9UK73 627 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM184BQ9ULE4 1060 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.75□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TSPY2A6NKD2 308 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 KIAA0355O15063 1070 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAMTS4O75173 837 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TTLL1O95922 423 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SHHQ15465 462 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SKAP1Q86WV1 359 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TICAM2Q86XR7 235 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CHST13Q8NET6 341 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TOX2Q96NM4 488 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SPC25Q9HBM1 224 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FGAP02671 866 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RAG1P15918 1043 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ACLYP53396 1101 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TFAP4Q01664 338 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FPGSQ05932 587 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CPXCR1Q8N123 301 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MKL1Q969V6 931 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 KIFC2Q96AC6 838 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CEP95Q96GE4 821 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MTMR7Q9Y216 660 aa11.73□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TTC28Q96AY4 2481 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MYO9BQ13459 2157 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ELP1O95163 1332 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF213O14771 459 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 BMP3P12645 472 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 STAT2P52630 851 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC174Q6PII3 467 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM160B2Q86V87 743 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM161BQ96MY7 647 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ACAD9Q9H845 621 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 INCENPQ9NQS7 918 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM39AQ9NV64 488 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RIPK3Q9Y572 518 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 LCTP09848 1927 aa11.72□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 FOXP2O15409 715 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC4A3P48751 1232 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ACVR2BQ13705 512 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ALX1Q15699 326 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 TKFCQ3LXA3 575 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 SLFN13Q68D06 897 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ARMCX2Q7L311 632 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 GMCL1Q96IK5 515 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 STX8Q9UNK0 236 aa11.71□□□□□ -0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ZMYM6O95789 1325 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 RAD50Q92878 1312 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CHMLP26374 656 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 GJA9P57773 515 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KCNA10Q16322 511 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms