RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDE4BQ07343 736 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BADQ92934 168 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIFC2Q96AC6 838 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM161BQ96MY7 647 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FBXO40Q9UH90 709 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FEM1BQ9UK73 627 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PHF24Q9UPV7 400 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ALPK3Q96L96 1907 aa10.27□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM22K7EJ46 135 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPAA1O43292 621 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TTLL1O95922 423 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFB10O96000 172 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHGBP05060 677 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLTBP09497 229 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSPY3P0CV98 308 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSPY8P0CW00 308 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RASA1P20936 1047 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TLE2Q04725 743 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SHHQ15465 462 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCTPP1Q9H773 170 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRDM1O75626 825 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FDX1P10109 184 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SNX17Q15036 470 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHST13Q8NET6 341 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OSBP2Q969R2 916 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FSD1Q9BTV5 496 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NAPBQ9H115 298 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1W2PQY0 241 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP2A1O14983 1001 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BMP3P12645 472 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ACLYP53396 1101 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OAZ1P54368 228 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FPGSQ05932 587 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLFN13Q68D06 897 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC174Q6PII3 467 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 REPS2Q8NFH8 660 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MKL1Q969V6 931 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.24□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TLR3O15455 904 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC1A4P43007 532 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TFAP4Q01664 338 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ACVR2BQ13705 512 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KCNA10Q16322 511 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C9orf50Q5SZB4 431 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM160B2Q86V87 743 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CEP95Q96GE4 821 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TOX2Q96NM4 488 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms