RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 TRPV1Q8NER1 839 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 MTMR7Q9Y216 660 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ACAD9Q9H845 621 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 KAT14Q9H8E8 782 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 TINF2Q9BSI4 451 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 RNF146Q9NTX7 359 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 PNMA2Q9UL42 364 aa20.16■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 SLC16A2P36021 539 aa20.15■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.15■□□□□ 0.82
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HERC3-214ENST00000601319 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.14■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.14■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.12■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HERC3-214ENST00000601319 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.1■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 ERICH2A1L162 156 aa20.09■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 NECTIN1Q15223 517 aa20.09■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HERC3-214ENST00000601319 SLC27A2O14975 620 aa20.08■□□□□ 0.81
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HERC3-214ENST00000601319 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HERC3-214ENST00000601319 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-214ENST00000601319 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.07■□□□□ 0.8
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HERC3-214ENST00000601319 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HERC3-214ENST00000601319 ANTXR2P58335 489 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-214ENST00000601319 WTAPQ15007 396 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-214ENST00000601319 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HERC3-214ENST00000601319 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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HERC3-214ENST00000601319 ARMCX2Q7L311 632 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-214ENST00000601319 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.07■□□□□ 0.8
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