RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ERC2	O15083	957 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ASGR1	P07306	291 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MKL1	Q969V6	931 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TIMP1	P01033	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FDX1	P10109	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SLC1A4	P43007	532 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	OAZ1	P54368	228 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ELP1	O95163	1332 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ALAS1	P13196	640 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MCC	P23508	829 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	STAT2	P52630	851 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PPARA	Q07869	468 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ASB14	A6NK59	587 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ARVCF	O00192	962 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	GJA9	P57773	515 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	BEX3	Q00994	111 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ADCY6	O43306	1168 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ACR	P10323	421 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CSF2RA	P15509	400 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	DNAJB2	P25686	324 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	SNAP25	P60880	206 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	FGD4	Q96M96	766 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ZEB2	O60315	1214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CDK7	P50613	346 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CABYR	O75952	493 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	MX1	P20591	662 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	CYP2C18	P33260	490 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP36-223	ENST00000592326	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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