RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF25Q93038 417 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PGBD1Q96JS3 809 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L10C9JJH3 530 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FDX1P10109 184 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC16A2P36021 539 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO11Q86XK2 927 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 WRNIP1Q96S55 665 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR18Q9BV38 432 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.731e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-212ENST00000591041 TNMDQ9H2S6 317 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRG0 241 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2B1P20020 1258 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPAQ15257 358 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K11Q16584 847 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CPVLQ9H3G5 476 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 C19orf81C9J6K1 198 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHX2P34913 555 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ECE1P42892 770 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 JAG1P78504 1218 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 NPY5RQ15761 445 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TNS4Q8IZW8 715 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ACER1Q8TDN7 264 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 DACT1Q9NYF0 836 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPREP23469 700 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 MRE11P49959 708 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CSADQ9Y600 493 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2N6 131 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 AP3B2Q13367 1082 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 NEK8Q86SG6 692 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 COA7Q96BR5 231 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY26PQ9H489 355 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 DOCK1Q14185 1865 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SYCE3A1L190 88 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 LIG1P18858 919 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TXLNAP40222 546 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SHISA4Q96DD7 197 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TIGD1Q96MW7 591 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN4AP35499 1836 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC192P0DO97 292 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SDF4Q9BRK5 362 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCB11O95342 1321 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 CAVIN2O95810 425 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 INPP5BP32019 993 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SYKP43405 635 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K9P80192 1104 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF174Q15697 407 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 RESP18Q5W5W9 173 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 KANK3Q6NY19 840 aa25.75■■□□□ 1.71
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