RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.41■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 TOMM22Q9NS69 142 aa24.41■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 NMT2O60551 498 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 PGK1P00558 417 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 NUCB1Q02818 461 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 DCAF4Q8WV16 495 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 FERMT2Q96AC1 680 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.39■■□□□ 1.5
NFIC-209ENST00000589969 ACVR2BQ13705 512 aa24.39■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TRIM60Q495X7 471 aa24.39■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 KCTD1Q719H9 257 aa24.39■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ZNF536O15090 1300 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ADAMTS4O75173 837 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 RNF146Q9NTX7 359 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.38■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 POTEB2H3BUK9 544 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 IGHDP01880 384 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 SDSP20132 328 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 NT5C2P49902 561 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 A0A1W2PQY0 241 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CCDC96Q2M329 555 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ARMCX2Q7L311 632 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 FGD4Q96M96 766 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 SPC25Q9HBM1 224 aa24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ASB14A6NK59 587 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 HIP1O00291 1037 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ALAS1P13196 640 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TLE2Q04725 743 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TTC14Q96N46 770 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.35■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ACLYP53396 1101 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 HAND2P61296 217 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CCDC174Q6PII3 467 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 PNMA2Q9UL42 364 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 MTMR7Q9Y216 660 aa24.34■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 ICAM1P05362 532 aa24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CNTN2Q02246 1040 aa24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.33■■□□□ 1.49
NFIC-209ENST00000589969 CLTBP09497 229 aa24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 KCNA10Q16322 511 aa24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 DEFB123Q8N688 67 aa24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 ESR2Q92731 530 aa24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 TOX2Q96NM4 488 aa24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 ZNF213O14771 459 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 GJA9P57773 515 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 BADQ92934 168 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 KATNBL1Q9H079 304 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 ELP1O95163 1332 aa24.31■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 SNAP25P60880 206 aa24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.29■■□□□ 1.48
NFIC-209ENST00000589969 KIAA0355O15063 1070 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms