RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 DAPK1P53355 1430 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 KRBA1A5PL33 1030 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 NFICP08651 508 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 RAB6AP20340 208 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 HOMER1Q86YM7 354 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM192Q8IY95 271 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 LILRB2Q8N423 598 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 APPBP2Q92624 585 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 FANCLQ9NW38 375 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 B2RBV5 119 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 YY1P25490 414 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 NCAPHQ15003 741 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 VHLLQ6RSH7 139 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 CEP152O94986 1710 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 BMP3P12645 472 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 CHRNA4P43681 627 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 CD163Q86VB7 1156 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-208ENST00000578600 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 MAP7Q14244 749 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 VPS72Q15906 364 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 VWCEQ96DN2 955 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 DCAF5Q96JK2 942 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A18Q96N87 628 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 ESYT3A0FGR9 886 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SLITRK5O94991 958 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 GBP1P32455 592 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SLC7A5Q01650 507 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 RIN3Q8TB24 985 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 LGR6Q9HBX8 967 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 HFM1A2PYH4 1435 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PTPROQ16827 1216 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 BBS9Q3SYG4 887 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 GNPTABQ3T906 1256 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf27AQ580R0 203 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 SPATC1Q76KD6 591 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 UNC13BO14795 1591 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRL2O95490 1459 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.49□□□□□ -1.21
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