RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	UTY	O14607	1347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	REV3L	O60673	3130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ADCY3	O60266	1144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE8B	O95263	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SGPL1	O95470	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FCGRT	P55899	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	UBXN2A	P68543	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GDF15	Q99988	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MAST3	O60307	1309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PPC1	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PEX10	O60683	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SYN1	P17600	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	IGFBP4	P22692	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXD10	P28358	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PHKA1	P46020	1223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RGS3	P49796	1198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GAK	O14976	1311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PFAS	O15067	1338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RLF	Q13129	1914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CXCL11	O14625	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MAN1A2	O60476	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRA	P18433	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ADORA1	P30542	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	EPHA4	P54764	986 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PICALM	Q13492	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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