RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM201Q5SNT2 666 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF280DQ6N043 979 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 WAPLQ7Z5K2 1190 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SMC5Q8IY18 1101 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SLFN12Q8IYM2 578 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 OTUD6BQ8N6M0 293 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 FAM13CQ8NE31 585 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 UBXN4Q92575 508 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TCF3P15923 654 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PLCG1P19174 1290 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 LAPTM5Q13571 262 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 LIG3P49916 1009 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 RAB3GAP1Q15042 981 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 USP40Q9NVE5 1235 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TCFL5Q9UL49 500 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CORINQ9Y5Q5 1042 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GRIN3BO60391 1043 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PFKLP17858 780 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RHBDL3P58872 404 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP4BP1P59074 171 aa3.83□□□□□ -1.8
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