RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575570.1

TBC1D28-208, Transcript of TBC1 domain family member 28, human

TSL 5

Gene TBC1D28, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D28-208	ENST00000575570	SLC27A2	O14975	620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ICAM1	P05362	532 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MYH6	P13533	1939 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ERICH2	A1L162	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MSC	O60682	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SLC16A2	P36021	539 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CYBA	P13498	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CYP2C19	P33261	490 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	ANTXR2	P58335	489 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	LHX8	Q68G74	356 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAF1	Q9H063	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	RNF146	Q9NTX7	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PFAS	O15067	1338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PGK2	P07205	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	ALAS1	P13196	640 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MCM5	P33992	734 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	WTAP	Q15007	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	SEPT4	O43236	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	LIFR	P42702	1097 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	SNAP25	P60880	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TROAP	Q12815	778 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	KCNB2	Q92953	911 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	FGD4	Q96M96	766 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	LCT	P09848	1927 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PRC1	O43663	620 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	REC8	O95072	547 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	KRT32	Q14532	448 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	GRM4	Q14833	912 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TBC1D28-208	ENST00000575570	ASB14	A6NK59	587 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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