RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 F5H6K3 240 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 BEX3Q00994 111 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 KLRC3Q07444 240 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 RAB30Q15771 203 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ZBED4O75132 1171 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 RASA1P20936 1047 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 UBE3CQ15386 1083 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 IL27Q8NEV9 243 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 HAUS7Q99871 368 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 IL23AQ9NPF7 189 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 HOMER2Q9NSB8 354 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 UMODL1Q5DID0 1318 aa21■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CTAGE5O15320 804 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ATP5JP18859 108 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 HERVK_113Q902F9 699 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 NYAP2Q9P242 653 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ATP2A1O14983 1001 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CD4P01730 458 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 HIPK3Q9H422 1215 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 HMMRO75330 724 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 FGBP02675 491 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 PTGS1P23219 599 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 RABGGTBP53611 331 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CCL23P55773 120 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CNTN2Q02246 1040 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 KATNBL1Q9H079 304 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 ASTN1O14525 1302 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 REV3LO60673 3130 aa20.96■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 CHST13Q8NET6 341 aa20.96■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO40Q9UH90 709 aa20.96■□□□□ 0.95
CCDC40-211ENST00000574099 RAB11FIP3O75154 756 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 TNFAIP2Q03169 654 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 TLK2Q86UE8 772 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 FEM1BQ9UK73 627 aa20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM1O75626 825 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 MYOGP15173 224 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 SBK1Q52WX2 424 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 CEP95Q96GE4 821 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 ITGA7Q13683 1181 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 ACAD9Q9H845 621 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 ZBBXA8MT70 800 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 B4GALT4O60513 344 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 OAZ1P54368 228 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 PSMC6P62333 389 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 NKX3-2P78367 333 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 TFF2Q03403 129 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 RNF146Q9NTX7 359 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 GRIN2DO15399 1336 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 CABYRO75952 493 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 BMP3P12645 472 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC40-211ENST00000574099 PLA2G5P39877 138 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms