RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.75■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.75■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.75■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 SNAP25P60880 206 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 RNF180Q86T96 592 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 LRCH3Q96II8 777 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ACAD9Q9H845 621 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 RNF146Q9NTX7 359 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ZMYM6O95789 1325 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G6O60733 806 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ALAS1P13196 640 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TDHQ8IZJ6 230 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 LTBP2Q14767 1821 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 LAMA4Q16363 1823 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF536O15090 1300 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM60Q495X7 471 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF4Q8WV16 495 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 POTEB2H3BUK9 544 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 NOVP48745 357 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 ACVR2BQ13705 512 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TKFCQ3LXA3 575 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 PHF24Q9UPV7 400 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 SZT2Q5T011 3432 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP4C-211ENST00000567642 CNTN2Q02246 1040 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ARMCX2Q7L311 632 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 FGD4Q96M96 766 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 HIP1O00291 1037 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SLC16A2P36021 539 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF213O14771 459 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS4O75173 837 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SNX17Q15036 470 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQY0 241 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 LCTP09848 1927 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 NSMFQ6X4W1 530 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ESR2Q92731 530 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 NEDD4P46934 1319 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ICAM1P05362 532 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TLE2Q04725 743 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 TTC14Q96N46 770 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SPC25Q9HBM1 224 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ASB14A6NK59 587 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 PDHBP11177 359 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 ACLYP53396 1101 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 KCNA10Q16322 511 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.64■■□□□ 1.54
PPP4C-211ENST00000567642 MYH6P13533 1939 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 MYADML2A6NDP7 307 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 ADCY6O43306 1168 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.63■■□□□ 1.53
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