RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-206	ENST00000563597	ACAD9	Q9H845	621 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	RAD50	Q92878	1312 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	KBTBD13	C9JR72	458 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	RNF146	Q9NTX7	359 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-206	ENST00000563597	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	RARB	P10826	455 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	PDHB	P11177	359 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	AKR1A1	P14550	325 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC174	Q6PII3	467 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	IQCA1	Q86XH1	822 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	KDM4A	O75164	1064 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ALAS1	P13196	640 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	IL25	Q9H293	177 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ICAM1	P05362	532 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SNHG28	P0DPA3	235 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC16A2	P36021	539 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SNAP25	P60880	206 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	LRRC41	Q15345	812 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	FGD4	Q96M96	766 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597		A0A1W2PPC1	479 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	POTEB2	H3BUK9	544 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	KRT23	Q9C075	422 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597		B4E1Z4	1266 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CHML	P26374	656 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	RNF180	Q86T96	592 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	SYN1	P17600	705 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	CNTN2	Q02246	1040 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	GDF15	Q99988	308 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	PNMA2	Q9UL42	364 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-206	ENST00000563597	ACVR2B	Q13705	512 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ARMCX2	Q7L311	632 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	BMP8B	P34820	402 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	PGK1	P00558	417 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	PHF24	Q9UPV7	400 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	MCM3AP	O60318	1980 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ASB14	A6NK59	587 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	RTP1	P59025	263 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	TNKS	O95271	1327 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAMTS4	O75173	837 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	SNX17	Q15036	470 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	NSMF	Q6X4W1	530 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	SGSM2	O43147	1006 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	FERMT2	Q96AC1	680 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-206	ENST00000563597	KATNBL1	Q9H079	304 aa		29.08	■■■□□ 2.25

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