RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SNHG28	P0DPA3	235 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	PDHB	P11177	359 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	ANO1	Q5XXA6	986 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM3AP	O60318	1980 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD50	Q92878	1312 aa		25.64	■■□□□ 1.7
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CHML	P26374	656 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC96	Q2M329	555 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAD9	Q9H845	621 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM4A	O75164	1064 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAP25	P60880	206 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	TKFC	Q3LXA3	575 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKH	Q86XP1	1220 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF146	Q9NTX7	359 aa		25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	25.63	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A2	P36021	539 aa		25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC174	Q6PII3	467 aa		25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKS1A	Q92625	1134 aa		25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	25.62	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200		B4E1Z4	1266 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF543	Q08ER8	600 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	25.61	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ICAM1	P05362	532 aa		25.6	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		25.6	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ALAS1	P13196	640 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC41	Q15345	812 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCA1	Q86XH1	822 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		25.59	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	RARB	P10826	455 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1A1	P14550	325 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTN2	Q02246	1040 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	LCT	P09848	1927 aa		25.58	■■□□□ 1.69
PPP4C-205	ENST00000563200	PTH1R	Q03431	593 aa		25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF15	Q99988	308 aa		25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT23	Q9C075	422 aa		25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	25.57	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD13	C9JR72	458 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEB2	H3BUK9	544 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SGSM2	O43147	1006 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX2	Q7L311	632 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KATNBL1	Q9H079	304 aa		25.56	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ASTN1	O14525	1302 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SYN1	P17600	705 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ACVR2B	Q13705	512 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA1	Q8ND90	353 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TNKS	O95271	1327 aa		25.55	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS4	O75173	837 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PGK1	P00558	417 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF24	Q9UPV7	400 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP21A2	P08686	494 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX17	Q15036	470 aa		25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	25.54	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY6	O43306	1168 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP8B	P34820	402 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT14	Q9H8E8	782 aa		25.53	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	25.52	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		25.52	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		25.52	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPC1	479 aa		25.52	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		25.52	■■□□□ 1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		25.52	■■□□□ 1.68

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