RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRF1Q92994 677 aa20.35■□□□□ 0.85
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CCNDBP1-204ENST00000563065 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.35■□□□□ 0.85
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLXNB2O15031 1838 aa20.35■□□□□ 0.85
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CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRCA2P51587 3418 aa20.29■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.28■□□□□ 0.84
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CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC27P30260 824 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCTD2Q14681 263 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIB2Q92519 343 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF2CQ99661 725 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACAD9Q9H845 621 aa20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFIBO00712 420 aa20.27■□□□□ 0.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB5O15062 677 aa20.27■□□□□ 0.84
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CCNDBP1-204ENST00000563065 TKFCQ3LXA3 575 aa20.27■□□□□ 0.84
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