RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC96Q2M329 555 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 RASGRP2Q7LDG7 609 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 AKR1A1P14550 325 aa38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 AGBL1Q96MI9 1066 aa38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 ACAD9Q9H845 621 aa38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 PRR12Q9ULL5 1215 aa38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF536O15090 1300 aa38.11■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 TBC1D10CQ8IV04 446 aa38.1■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM47Q9BQJ4 181 aa38.1■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 TKFCQ3LXA3 575 aa38.09■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 RNF146Q9NTX7 359 aa38.09■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 DNAH12Q6ZR08 3092 aa38.08■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF213O14771 459 aa38.08■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 ADCYAP1R1P41586 468 aa38.08■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 RTP1P59025 263 aa38.08■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC174Q6PII3 467 aa38.08■■■■□ 3.69
TTC7B-202ENST00000553948 SNAP25P60880 206 aa38.07■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa38.07■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 RNF180Q86T96 592 aa38.07■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ALAS1P13196 640 aa38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 TTC14Q96N46 770 aa38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 TRERF1Q96PN7 1200 aa38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 FAM184BQ9ULE4 1060 aa38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa38.06■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 PGK1P00558 417 aa38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ESR2Q92731 530 aa38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 FERMT2Q96AC1 680 aa38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 FGD4Q96M96 766 aa38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 LAMA4Q16363 1823 aa38.05■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 POTEB2H3BUK9 544 aa38.04■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 PDE4AP27815 886 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 CNTN2Q02246 1040 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ACVR2BQ13705 512 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 TTBK2Q6IQ55 1244 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 BTNL9Q6UXG8 535 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 DSCC1Q9BVC3 393 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 PHF24Q9UPV7 400 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 NEDD4P46934 1319 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 SLC16A2P36021 539 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ARMCX2Q7L311 632 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 FAM133AQ8N9E0 248 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 GPCPD1Q9NPB8 672 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 CCPG1Q9ULG6 757 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 MCM3APO60318 1980 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 SNX17Q15036 470 aa38.01■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 SYDE2Q5VT97 1194 aa38.01■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
TTC7B-202ENST00000553948 ICAM1P05362 532 aa38■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 NT5C2P49902 561 aa38■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa38■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTS4O75173 837 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 PDHBP11177 359 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 MUM1L1Q5H9M0 696 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 TTC22Q5TAA0 569 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 TDHQ8IZJ6 230 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 CTNNA3Q9UI47 895 aa37.99■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM60Q495X7 471 aa37.98■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 C1orf53Q5VUE5 145 aa37.98■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa37.98■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC144BQ3MJ40 725 aa37.97■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 SOWAHBA6NEL2 793 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 KDM4AO75164 1064 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF543Q08ER8 600 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC178Q5BJE1 867 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 IQCA1Q86XH1 822 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 DGKHQ86XP1 1220 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 CYP39A1Q9NYL5 469 aa37.96■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 A0A1W2PQY0 241 aa37.95■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 ASB14A6NK59 587 aa37.95■■■■□ 3.67
TTC7B-202ENST00000553948 SNHG28P0DPA3 235 aa37.94■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 NSMFQ6X4W1 530 aa37.94■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 KLHDC9Q8NEP7 349 aa37.93■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 LRCH3Q96II8 777 aa37.93■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 KATNBL1Q9H079 304 aa37.93■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 B4E1Z4 1266 aa37.92■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 ACLYP53396 1101 aa37.92■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 SPC25Q9HBM1 224 aa37.92■■■■□ 3.66
TTC7B-202ENST00000553948 PNMA2Q9UL42 364 aa37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms