RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TSPY3P0CV98 308 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 TSPY8P0CW00 308 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 BMP3P12645 472 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 ELP1O95163 1332 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 OAZ1P54368 228 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 ARMCX2Q7L311 632 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 EYSQ5T1H1 3165 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 TMEM232C9JQI7 657 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 ADCY6O43306 1168 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 GJA9P57773 515 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 TFAP4Q01664 338 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 PDE4BQ07343 736 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 GNASQ5JWF2 1037 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 FGD4Q96M96 766 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.839e-7■■□□□ 12.9
CS-214ENST00000548849 TBX21Q9UL17 535 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 FDX1P10109 184 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 DNAJB2P25686 324 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 CDK7P50613 346 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 MFSD5Q6N075 450 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 NAPBQ9H115 298 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 ACAD9Q9H845 621 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 MCM3APO60318 1980 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-214ENST00000548849 ARVCFO00192 962 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 STAT2P52630 851 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CNTN2Q02246 1040 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.821e-7■■□□□ 12.1
CS-214ENST00000548849 GRIN2CQ14957 1233 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 VCANP13611 3396 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ERC2O15083 957 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 SLC1A4P43007 532 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PPARAQ07869 468 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CCDC174Q6PII3 467 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 FAM160B2Q86V87 743 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TMEM199Q8N511 208 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 FSD1Q9BTV5 496 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 KATNBL1Q9H079 304 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 RNF146Q9NTX7 359 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CSF2RAP15509 400 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 MCCP23508 829 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 BEX3Q00994 111 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TNFAIP2Q03169 654 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TIFAQ96CG3 184 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ZNF576Q9H609 170 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ASB14A6NK59 587 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ALAS1P13196 640 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TKFCQ3LXA3 575 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TMEM240Q5SV17 173 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 GMCL1Q96IK5 515 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 STX8Q9UNK0 236 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ZNF536O15090 1300 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 TSPY2A6NKD2 308 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CTAGE5O15320 804 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ACRP10323 421 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 KCTD1Q719H9 257 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 SNAP25P60880 206 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ZNF365Q70YC5 407 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 MTMR7Q9Y216 660 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.14■□□□□ 0.82
CS-214ENST00000548849 ASTN1O14525 1302 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-214ENST00000548849 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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