RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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POLR1B-217ENST00000541869 CCDC114Q96M63 670 aa11.47□□□□□ -0.57
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POLR1B-217ENST00000541869 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 NEK8Q86SG6 692 aa11.46□□□□□ -0.58
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POLR1B-217ENST00000541869 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
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POLR1B-217ENST00000541869 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 TRPA1O75762 1119 aa11.44□□□□□ -0.58
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POLR1B-217ENST00000541869 ACAD9Q9H845 621 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 ZMYM6O95789 1325 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 ANXA13P27216 316 aa11.44□□□□□ -0.58
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POLR1B-217ENST00000541869 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
POLR1B-217ENST00000541869 NEDD9Q14511 834 aa11.44□□□□□ -0.58
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