RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNMA2Q9UL42 364 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MCM3APO60318 1980 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ICAM1P05362 532 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NECTIN1Q15223 517 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTA3Q9BTC8 594 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACAD9Q9H845 621 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYBAP13498 195 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERICH2A1L162 156 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC27A2O14975 620 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSCO60682 206 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC16A2P36021 539 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX11Q96FC9 970 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF146Q9NTX7 359 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALPK3Q96L96 1907 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PGK2P07205 417 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP2C19P33261 490 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF20Q5VTR2 975 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC174Q6PII3 467 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PFASO15067 1338 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALAS1P13196 640 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC4A3P48751 1232 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANTXR2P58335 489 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WTAPQ15007 396 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TINF2Q9BSI4 451 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LHX8Q68G74 356 aa18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MCM5P33992 734 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNAP25P60880 206 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPV1Q8NER1 839 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM87BQ96K49 555 aa18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEPT4O43236 478 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRM4Q14833 912 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FGD4Q96M96 766 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAF1Q9H063 256 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRC1O43663 620 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TROAPQ12815 778 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHST3Q7LGC8 479 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP3K14Q99558 947 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LY9Q9HBG7 655 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POTEB2H3BUK9 544 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REC8O95072 547 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNGA1P29973 690 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT32Q14532 448 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMTC2Q8N394 836 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPVLQ9H3G5 476 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SENP2Q9HC62 589 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNPY2Q9Y2B0 182 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCB11O95342 1321 aa18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms