RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ESYT2A0FGR8 921 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 M0R2N6 131 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 SPP2Q13103 211 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 PTPAQ15257 358 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 WDR18Q9BV38 432 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 MTMR2Q13614 643 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.518e-6■■□□□ 11.7
CITED2-202ENST00000536159 LPAR1Q92633 364 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 MAP3K9P80192 1104 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 KIFC2Q96AC6 838 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 FEM1BQ9UK73 627 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 TRIM75PA6NK02 468 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 NF2P35240 595 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ADCY7P51828 1080 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 USP14P54578 494 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 FAM160B2Q86V87 743 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 JMYQ8N9B5 988 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 CDCA5Q96FF9 252 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 AMNQ9BXJ7 453 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.47■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 PLA2G6O60733 806 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 PPP6R2O75170 966 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 DGKZQ13574 1117 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 ADALQ6DHV7 355 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 FBXO11Q86XK2 927 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CITED2-202ENST00000536159 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 LIG1P18858 919 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TRAPPC10P48553 1259 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 BACE1P56817 501 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TTC38Q5R3I4 469 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 ZNF174Q15697 407 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 USH1GQ495M9 461 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 CUL5Q93034 780 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 PANK2Q9BZ23 570 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 WNT7AO00755 349 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 VGLL4Q14135 290 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TMEM260Q9NX78 707 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 CSADQ9Y600 493 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 INF2Q27J81 1249 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 RRAGCQ9HB90 399 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 A0A1W2PQ27 194 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 A0A1W2PQ64 194 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 A0A1W2PQD8 194 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 VCAM1P19320 739 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 CCDC174Q6PII3 467 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 FSIP1Q8NA03 581 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 RBSNQ9H1K0 784 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TSPY26PQ9H489 355 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 SCN4AP35499 1836 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 C19orf81C9J6K1 198 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 BMP15O95972 392 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 POTEIP0CG38 1075 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 POTEJP0CG39 1038 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 DACT1Q9NYF0 836 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 DOCK1Q14185 1865 aa24.41■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 NR1I2O75469 434 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 MCM7P33993 719 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 HMGCS2P54868 508 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 TRAF1Q13077 416 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 UBE2SQ16763 222 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CITED2-202ENST00000536159 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms