RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A3P48751 1232 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SOX10P56693 466 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD2Q14681 263 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 DPP9Q86TI2 863 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST13Q8NET6 341 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ICAM1P05362 532 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LIFRP42702 1097 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TROAPQ12815 778 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GRM4Q14833 912 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MTFR1Q15390 333 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL14Q16627 93 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TKFCQ3LXA3 575 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TMTC2Q8N394 836 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 USP26Q9BXU7 913 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CPVLQ9H3G5 476 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO40Q9UH90 709 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 COBLO75128 1261 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ACAD9Q9H845 621 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF146Q9NTX7 359 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DDAH1O94760 285 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ALAS1P13196 640 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL5P13501 91 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM32Q13049 653 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA2Q9UL42 364 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC69A6NI79 296 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRF2D3W0D1 207 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K14Q99558 947 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEFA5A3E0 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PGK2P07205 417 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX11Q96FC9 970 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MAML3Q96JK9 1138 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF208Q9H0X6 261 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RPTORQ8N122 1335 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHA2P01877 340 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL10Q9BUA6 226 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 GJB1P08034 283 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CALM1P0DP23 149 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CALM2P0DP24 149 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CALM3P0DP25 149 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CPA1P15085 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMA5P28066 241 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF5BP33176 963 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR8Q96EF0 704 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 PFASO15067 1338 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2C19P33261 490 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS19P49795 217 aa22.12■■□□□ 1.13
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