RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527193.1

PPP5C-212, Transcript of protein phosphatase 5 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP5C, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5C-212ENST00000527193 A0A1W2PQY0 241 aa27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ADAMTS4O75173 837 aa27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.93■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ACVR2BQ13705 512 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 KCTD1Q719H9 257 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 BADQ92934 168 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 FAM227BQ96M60 508 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 FGD4Q96M96 766 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ACAD9Q9H845 621 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ALX1Q15699 326 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 A0A0D9SFI3 127 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ORC4O43929 436 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ARMCX2Q7L311 632 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TOMM22Q9NS69 142 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 RNF146Q9NTX7 359 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 MTMR7Q9Y216 660 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ZNF536O15090 1300 aa27.9■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 PLA2G6O60733 806 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 CLTBP09497 229 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 ACLYP53396 1101 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 CNTN2Q02246 1040 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC144BQ3MJ40 725 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 LNPKQ9C0E8 428 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP5C-212ENST00000527193 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 POTEB2H3BUK9 544 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 FGAP02671 866 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 SNAP25P60880 206 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 SHHQ15465 462 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 KCNA10Q16322 511 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC174Q6PII3 467 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 KLHDC9Q8NEP7 349 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 TRERF1Q96PN7 1200 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 STARD7Q9NQZ5 370 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 FGRP09769 529 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ALAS1P13196 640 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC96Q2M329 555 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 TKFCQ3LXA3 575 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 TICAM2Q86XR7 235 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 MYADML2A6NDP7 307 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ADCY6O43306 1168 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 SPC25Q9HBM1 224 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ITGB8P26012 769 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 NOVP48745 357 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 DCAF4Q8WV16 495 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 RILPL2Q969X0 211 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 KIAA0355O15063 1070 aa27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 RAG1P15918 1043 aa27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CST5P28325 142 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 KATNBL1Q9H079 304 aa27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 SOWAHBA6NEL2 793 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 DCDC2CA8MYV0 355 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 GJA9P57773 515 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 TOX2Q96NM4 488 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ZMYM6O95789 1325 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP5C-212ENST00000527193 ASB14A6NK59 587 aa27.82■■■□□ 2.04
PPP5C-212ENST00000527193 TOP1P11387 765 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PPP5C-212ENST00000527193 HAND2P61296 217 aa27.82■■■□□ 2.04
PPP5C-212ENST00000527193 FAAP100Q0VG06 881 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms