RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 ADCY6O43306 1168 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 KCTD1Q719H9 257 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM160B2Q86V87 743 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 BADQ92934 168 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM184BQ9ULE4 1060 aa18.56■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 MYADML2A6NDP7 307 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FDX1P10109 184 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CNTN2Q02246 1040 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ACVR2BQ13705 512 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ALX1Q15699 326 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ACAD9Q9H845 621 aa18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ORC4O43929 436 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FGRP09769 529 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ITGB8P26012 769 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 NOVP48745 357 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ACLYP53396 1101 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 SNAP25P60880 206 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 SHHQ15465 462 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ARMCX2Q7L311 632 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 LNPKQ9C0E8 428 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 RNF146Q9NTX7 359 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 PLA2G6O60733 806 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FGAP02671 866 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CLTBP09497 229 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 KCNA10Q16322 511 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC144BQ3MJ40 725 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 KATNBL1Q9H079 304 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 MTMR7Q9Y216 660 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 POTEB2H3BUK9 544 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ALAS1P13196 640 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC174Q6PII3 467 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-206ENST00000526095 ASTN1O14525 1302 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 ZMYM6O95789 1325 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TKFCQ3LXA3 575 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 SMC5Q8IY18 1101 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TOMM22Q9NS69 142 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA0355O15063 1070 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 GJA9P57773 515 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 FAAP100Q0VG06 881 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC96Q2M329 555 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TICAM2Q86XR7 235 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 DCAF4Q8WV16 495 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 CTAGE5O15320 804 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 ASGR1P07306 291 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 EPHB4P54760 987 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 HAND2P61296 217 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 RILPL2Q969X0 211 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TOX2Q96NM4 488 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 GUCD1Q96NT3 240 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-206ENST00000526095 IGHDP01880 384 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms