RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SHOXO15266 292 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CDR1P51861 262 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 TMC6Q7Z403 805 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 USP48Q86UV5 1035 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 NAT16Q8N8M0 369 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PANK1Q8TE04 598 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 MZB1Q8WU39 189 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 C20orf173Q96LM9 149 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 TM9SF2Q99805 663 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 NUDT19A8MXV4 375 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 TRIM13O60858 407 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 RTP2Q5QGT7 225 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 JMJD8Q96S16 334 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQ27 194 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQ64 194 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQC6 194 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQD8 194 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 GSTM1P09488 218 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 LDHDQ86WU2 507 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 RELTQ969Z4 430 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 H0Y8X5 98 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 SASH1O94885 1247 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 FANCCQ00597 558 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 DCAF15Q66K64 600 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 RPTNQ6XPR3 784 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 JAMLQ86YT9 394 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 BACH2Q9BYV9 841 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 GUCY2CP25092 1073 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 NR1I3Q14994 352 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 ZNF394Q53GI3 561 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 FAM129CQ86XR2 697 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 GP6Q9HCN6 339 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 ZNF445P59923 1031 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 BRF1Q92994 677 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-211ENST00000522045 ITGA4P13612 1032 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 CD247P20963 164 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 MAPKAPK2P49137 400 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 MVKQ03426 396 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 NFIXQ14938 502 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 FIBCD1Q8N539 461 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 PPT2Q9UMR5 302 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 SP8Q8IXZ3 490 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 RNF34Q969K3 372 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQJ5 194 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 MSL3P1P0C860 447 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 RGS22Q8NE09 1264 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 PWWP2AQ96N64 755 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-211ENST00000522045 SRGAP3O43295 1099 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.4 ms