RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520647.5

GALNT10-208, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, humanhuman

TSL 2

Gene GALNT10, Length 4,359 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT10-208ENST00000520647 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PPARAQ07869 468 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 MMS19Q96T76 1030 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZNF185O15231 689 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 FTCDO95954 541 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ELF1P32519 619 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 GJC1P36383 396 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZNF76P36508 570 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KRT31Q15323 416 aa20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PRR29P0C7W0 189 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZNF131P52739 623 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 USP14P54578 494 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CALCOCO2Q13137 446 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PTGDRQ13258 359 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CNPY4Q8N129 248 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 RIMBP2O15034 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 HOOK3Q86VS8 718 aa20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LAMC1P11047 1609 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KRIT1O00522 736 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 APOA5Q6Q788 366 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PEX26Q7Z412 305 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TC2NQ8N9U0 490 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TFR2Q9UP52 801 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SEC24CP53992 1094 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 NAPAP54920 295 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LRRC24Q50LG9 513 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 GBP1P32455 592 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SLC20A2Q08357 652 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 STMN2Q93045 179 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KLHL29Q96CT2 875 aa20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 MAST3O60307 1309 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 POLE2P56282 527 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 GNPTABQ3T906 1256 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 FERMT2Q96AC1 680 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 H7C1D1 291 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LDHCP07864 332 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SHC4Q6S5L8 630 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PI16Q6UXB8 463 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SAAL1Q96ER3 474 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CHP1Q99653 195 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CCDC77Q9BR77 488 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KDRP35968 1356 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TRIM37O94972 964 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.871e-17■■■■■ 33
GALNT10-208ENST00000520647 MUM1Q2TAK8 710 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 L1RE1Q9UN81 338 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.48■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZMYM6O95789 1325 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 DLC1Q96QB1 1528 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SLCO1A2P46721 670 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 DENND2CQ68D51 928 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KRT14P02533 472 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 OSBP2Q969R2 916 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 GSDMAQ96QA5 445 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LLGL1Q15334 1064 aa20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 KIF28PB7ZC32 967 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 BAG3O95817 575 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 YY1AP1Q9H869 796 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ATP10DQ9P241 1426 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 LRRD1A4D1F6 860 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 CALML3P27482 149 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 TXKP42681 527 aa20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
GALNT10-208ENST00000520647 SCP2P22307 547 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms