RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514197.5

ANK3-223, Transcript of ankyrin 3, human

TSL 5

Gene ANK3, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANK3-223	ENST00000514197	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	HMX2	A2RU54	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197		A6NJY4	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197		M0R2C6	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ATP9B	O43861	1147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PDC	P20941	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	GJB2	P29033	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PHKA1	P46020	1223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CLDN10	P78369	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CHRND	Q07001	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	TRDN	Q13061	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	BHMT	Q93088	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	GLI3	P10071	1580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	MAST3	O60307	1309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197		E7EWF7	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF213	O14771	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	STX6	O43752	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PRNP	P04156	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CYP21A2	P08686	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PDE6A	P16499	860 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	FGFR2	P21802	821 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	MCAM	P43121	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	STK3	Q13188	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197		Q6ZUG5	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ANK3-223	ENST00000514197	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197		H3BQV1	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	GPAA1	O43292	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	MBD3	O95983	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	FGA	P02671	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	CHGB	P05060	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	GNAT2	P19087	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ADD2	P35612	726 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ST5	P78524	1137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	PKP1	Q13835	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	MTFR1	Q15390	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ME3	Q16798	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANK3-223	ENST00000514197	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62

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