RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CEP135Q66GS9 1140 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 HOMEZQ8IX15 550 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 FAM151AQ8WW52 585 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 DRC1Q96MC2 740 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NACC1Q96RE7 527 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 C5P01031 1676 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 AK9Q5TCS8 1911 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 M0R2C6 588 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 USP17L8P0C7I0 530 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 BCRP11274 1271 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 SCRN1Q12765 414 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 KRT76Q01546 638 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.51□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 PAX3P23760 479 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 MAN1A1P33908 653 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 GYG1P46976 350 aa6.5□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 HLFQ16534 295 aa6.5□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 SULF1Q8IWU6 871 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 NOX5Q96PH1 765 aa6.5□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 CCND2P30279 289 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CDK8P49336 464 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 TCP11Q8WWU5 503 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZEB2O60315 1214 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 MYZAPP0CAP1 466 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CAPN2P17655 700 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ADORA1P30542 326 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 CRKP46108 304 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZNF75DP51815 510 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 STAT2P52630 851 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 APBA1Q02410 837 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 STRN3Q13033 797 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 RESP18Q5W5W9 173 aa6.5□□□□□ -1.37
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POLK-215ENST00000514141 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 RNF214Q8ND24 703 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 MORC4Q8TE76 937 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 FBXO41Q8TF61 875 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 SPAG5Q96R06 1193 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 SPC25Q9HBM1 224 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 BARHL2Q9NY43 387 aa6.5□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.49□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 THAP12O43422 761 aa6.49□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 SEC24BO95487 1268 aa6.49□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
POLK-215ENST00000514141 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.49□□□□□ -1.37
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