RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ITGB8P26012 769 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ACLYP53396 1101 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 PDE1AP54750 535 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 KCTD1Q719H9 257 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 FAM160B2Q86V87 743 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.06■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ACAD9Q9H845 621 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.05■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 KIAA0355O15063 1070 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G6O60733 806 aa20.03■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 RAG1P15918 1043 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ALX1Q15699 326 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 CCDC174Q6PII3 467 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 TOX2Q96NM4 488 aa20.02■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 KATNBL1Q9H079 304 aa20.02■□□□□ 0.8
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.01■□□□□ 0.79
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HERC3-211ENST00000513325 DLL1O00548 723 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 ASGR1P07306 291 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 NOVP48745 357 aa20■□□□□ 0.79
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC96Q2M329 555 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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HERC3-211ENST00000513325 CTAGE5O15320 804 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TNFAIP2Q03169 654 aa19.98■□□□□ 0.79
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HERC3-211ENST00000513325 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 DCAF4Q8WV16 495 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A2P36021 539 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 CDK7P50613 346 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 HAND2P61296 217 aa19.97■□□□□ 0.79
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