RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 KIF16BQ96L93 1317 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 POU4F3Q15319 338 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 SVOPQ8N4V2 548 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 JMYQ8N9B5 988 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 CORO1BQ9BR76 489 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 PIK3R2O00459 728 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TM4SF5O14894 197 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 UBXN4Q92575 508 aa9.16□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.16□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 C4AP0C0L4 1744 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 BCAR3O75815 825 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TOMM70O94826 608 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 ATP2B1P20020 1258 aa9.15□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-210ENST00000512194 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.15□□□□□ -0.94
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HERC3-210ENST00000512194 FAM221AA4D161 298 aa9.14□□□□□ -0.95
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HERC3-210ENST00000512194 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 PALLDQ8WX93 1383 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 PTPRCP08575 1304 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 CILPO75339 1184 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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HERC3-210ENST00000512194 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.13□□□□□ -0.95
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HERC3-210ENST00000512194 FGRP09769 529 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 SOX9P48436 509 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 RAC1P63000 192 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 KRT24Q2M2I5 525 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-210ENST00000512194 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
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