RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSC	O60682	206 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF543	Q08ER8	600 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC96	Q2M329	555 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	DGKH	Q86XP1	1220 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASTN1	O14525	1302 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP21A2	P08686	494 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5C2	P49902	561 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC174	Q6PII3	467 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF146	Q9NTX7	359 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO40	Q9UH90	709 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNM1L	O00429	736 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	EVI5	O60447	810 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ICAM1	P05362	532 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTN2	Q02246	1040 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	TKFC	Q3LXA3	575 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX11	Q96FC9	970 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	KATNBL1	Q9H079	304 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAD9	Q9H845	621 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADCY6	O43306	1168 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALAS1	P13196	640 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC23A	Q15436	765 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA1	Q8ND90	353 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPVL	Q9H3G5	476 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNKS	O95271	1327 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC34A2	O95436	690 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC41	Q15345	812 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCA1	Q86XH1	822 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP4K1	Q92918	833 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT23	Q9C075	422 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	POTEB2	H3BUK9	544 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFIB	O00712	420 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMCX2	Q7L311	632 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	SENP2	Q9HC62	589 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014		E7EWF7	191 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS4	O75173	837 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGK1	P00558	417 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKR1A1	P14550	325 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACVR2B	Q13705	512 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	KAT14	Q9H8E8	782 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		14.9	□□□□□ -0.02

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