RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
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SH3BP2-215ENST00000510074 ATP2A1O14983 1001 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-215ENST00000510074 RAB11FIP3O75154 756 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-215ENST00000510074 NDUFB10O96000 172 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP5JP18859 108 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.93■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.93■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM232C9JQI7 657 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 B4GALT4O60513 344 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 PRDM1O75626 825 aa18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 MYOGP15173 224 aa18.9■□□□□ 0.62
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