RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505552.1

ITGA3-205, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-205ENST00000505552 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 ATL3Q6DD88 541 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.51□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 BLIDQ8IZY5 108 aa6.5□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 RRAGCQ9HB90 399 aa6.5□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 C19orf81C9J6K1 198 aa6.48□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 SPTLC2O15270 562 aa6.48□□□□□ -1.37
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ITGA3-205ENST00000505552 PTPREP23469 700 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 CALML3P27482 149 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 NF2P35240 595 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 TRAPPC10P48553 1259 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA3-205ENST00000505552 STAT2P52630 851 aa6.48□□□□□ -1.37
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