RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496530.1

SMARCD3-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCD3, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3-215ENST00000496530 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.52□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 PORCNQ9H237 461 aa9.52□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 FBXO40Q9UH90 709 aa9.52□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.52□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.51□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 ZBTB43O43298 467 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 CPLX1O14810 134 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 ABCB7O75027 752 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 PPFIA3O75145 1194 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 HOXC6P09630 235 aa9.48□□□□□ -0.89
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SMARCD3-215ENST00000496530 ZNF543Q08ER8 600 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 TRAF1Q13077 416 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 SEC23AQ15436 765 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 CCDC174Q6PII3 467 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 TRIB2Q92519 343 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 ACAD9Q9H845 621 aa9.48□□□□□ -0.89
SMARCD3-215ENST00000496530 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.48□□□□□ -0.89
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