RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 GSTM1P09488 218 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM253P0C7T8 217 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 CTSKP43235 329 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 RAP1GAPP47736 663 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 VHLLQ6RSH7 139 aa7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 JAMLQ86YT9 394 aa7.55□□□□□ -1.2
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RBM39-241ENST00000496183 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.24e-23■■□□□ 13.8
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.55□□□□□ -1.2
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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RBM39-241ENST00000496183 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.54□□□□□ -1.2
RBM39-241ENST00000496183 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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RBM39-241ENST00000496183 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.52□□□□□ -1.21
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RBM39-241ENST00000496183 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.5□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 NUP43Q8NFH3 380 aa7.5□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 ZNF428Q96B54 188 aa7.5□□□□□ -1.21
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RBM39-241ENST00000496183 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.48□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.48□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.48□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 SHISA4Q96DD7 197 aa7.48□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.48□□□□□ -1.21
RBM39-241ENST00000496183 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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