RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	FOXP2	O15409	715 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ORC4	O43929	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	IGHA2	P01877	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	HOXC6	P09630	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	BMP1	P13497	986 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP2C19	P33261	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	TLE2	Q04725	743 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	MKL1	Q969V6	931 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	RLF	Q13129	1914 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	NDUFB10	O96000	172 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	CYBA	P13498	195 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	SNX27	Q96L92	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBMS1-215	ENST00000492283	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	PTPRE	P23469	700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CHML	P26374	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FPGS	Q05932	587 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	ESR2	Q92731	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	RAD50	Q92878	1312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	NMT2	O60551	498 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBED4	O75132	1171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CNMD	O75829	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CLTB	P09497	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FGR	P09769	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	BMP3	P12645	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	RAG1	P15918	1043 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC1A4	P43007	532 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	GRB14	Q14449	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	MROH8	Q9H579	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	VWA5A	O00534	786 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	STRN	O43815	780 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC25A27	O95847	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	ERCC3	P19447	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	MCC	P23508	829 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	PBX2	P40425	430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	STAT3	P40763	770 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBMS1-215	ENST00000492283	TRDN	Q13061	729 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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