RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 FBXO40Q9UH90 709 aa24.93■■□□□ 1.58
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NELFE-210ENST00000491139 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 SBK1Q52WX2 424 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ARMCX2Q7L311 632 aa24.92■■□□□ 1.58
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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NELFE-210ENST00000491139 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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NELFE-210ENST00000491139 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.84■■□□□ 1.57
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NELFE-210ENST00000491139 COG6Q9Y2V7 657 aa24.84■■□□□ 1.57
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NELFE-210ENST00000491139 BMP3P12645 472 aa24.83■■□□□ 1.57
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NELFE-210ENST00000491139 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.82■■□□□ 1.56
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NELFE-210ENST00000491139 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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NELFE-210ENST00000491139 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-210ENST00000491139 ZEB2O60315 1214 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-210ENST00000491139 CCL23P55773 120 aa24.81■■□□□ 1.56
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NELFE-210ENST00000491139 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-210ENST00000491139 TMEM232C9JQI7 657 aa24.8■■□□□ 1.56
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