RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490240.5

MDK-210, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDK, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-210ENST00000490240 NYAP2Q9P242 653 aa22.18■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 ADCY6O43306 1168 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 NDUFB10O96000 172 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 CHGBP05060 677 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 SLC4A3P48751 1232 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 RAB30Q15771 203 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 FBXO40Q9UH90 709 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 MSRAQ9UJ68 235 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 MCM3APO60318 1980 aa22.17■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 ACRP10323 421 aa22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 RASA1P20936 1047 aa22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 ASB2Q96Q27 587 aa22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.16■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 ARMCX2Q7L311 632 aa22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 CHST13Q8NET6 341 aa22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 FGD4Q96M96 766 aa22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 IL23AQ9NPF7 189 aa22.15■■□□□ 1.14
MDK-210ENST00000490240 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ADGRE1Q14246 886 aa22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SBK1Q52WX2 424 aa22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 HERVK_113Q902F9 699 aa22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 KIFC2Q96AC6 838 aa22.14■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CD4P01730 458 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CYP2C18P33260 490 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 OAZ1P54368 228 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 NKX3-2P78367 333 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 FEM1BQ9UK73 627 aa22.13■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CTAGE5O15320 804 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 IGFBP4P22692 258 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 IL27Q8NEV9 243 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 KATNBL1Q9H079 304 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 MYH4Q9Y623 1939 aa22.12■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CABYRO75952 493 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 FGBP02675 491 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 HIPK3Q9H422 1215 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.11■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 BEX3Q00994 111 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 TNFAIP2Q03169 654 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 MKL1Q969V6 931 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.1■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 FDX1P10109 184 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CNTN2Q02246 1040 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.09■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 TLK2Q86UE8 772 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 CEP95Q96GE4 821 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ACAD9Q9H845 621 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 GBF1Q92538 1859 aa22.08■■□□□ 1.13
MDK-210ENST00000490240 ASTN1O14525 1302 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 ASB14A6NK59 587 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 TTLL1O95922 423 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 ITGA7Q13683 1181 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 DCTPP1Q9H773 170 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 ZEB2O60315 1214 aa22.06■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 BMP3P12645 472 aa22.06■■□□□ 1.12
MDK-210ENST00000490240 GPATCH3Q96I76 525 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms