RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TTLL1O95922 423 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GNAT2P19087 354 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CDK7P50613 346 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CNTN2Q02246 1040 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GNASQ5JWF2 1037 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 C16orf59Q7L2K0 433 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CHST13Q8NET6 341 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GPATCH3Q96I76 525 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 DCTPP1Q9H773 170 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TBX21Q9UL17 535 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM232C9JQI7 657 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRN-217ENST00000489650 TSPY3P0CV98 308 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TSPY8P0CW00 308 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 BMP3P12645 472 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 DNAJB2P25686 324 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GJA9P57773 515 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 MFSD5Q6N075 450 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 SPC25Q9HBM1 224 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 FBXO40Q9UH90 709 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ELP1O95163 1332 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ARVCFO00192 962 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ACRP10323 421 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 BEX3Q00994 111 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TFAP4Q01664 338 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 KATNBL1Q9H079 304 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CTAGE5O15320 804 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 OAZ1P54368 228 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 SNAP25P60880 206 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM240Q5SV17 173 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF576Q9H609 170 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 CSF2RAP15509 400 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 PTGS1P23219 599 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 PBX2P40425 430 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 USP38Q8NB14 1042 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ACAD9Q9H845 621 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 INCENPQ9NQS7 918 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 MCCP23508 829 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PDE4BQ07343 736 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TIFAQ96CG3 184 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.95■■□□□ 1.1
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PTPRN-217ENST00000489650 RNF146Q9NTX7 359 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF536O15090 1300 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2C18P33260 490 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 STAT2P52630 851 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TNFAIP2Q03169 654 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PPARAQ07869 468 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC174Q6PII3 467 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF365Q70YC5 407 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 KCTD1Q719H9 257 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM199Q8N511 208 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 NAPBQ9H115 298 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 ASTN1O14525 1302 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 ALAS1P13196 640 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 SLC1A4P43007 532 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PPM1EQ8WY54 764 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 FSD1Q9BTV5 496 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PBX4Q9BYU1 374 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 MTMR7Q9Y216 660 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 FDX1P10109 184 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.92■■□□□ 1.1
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