RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489527.1

GTPBP1-213, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-213	ENST00000489527	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527		A0A1W2PRG0	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	VWA5A	O00534	786 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SGSM2	O43147	1006 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CDC45	O75419	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CALM1	P0DP23	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CALM2	P0DP24	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CALM3	P0DP25	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PSMA5	P28066	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KIF5B	P33176	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCM4	P33991	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCM5	P33992	734 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	HAND2	P61296	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FGD1	P98174	961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MMP19	Q99542	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	APBA2	Q99767	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MYH6	P13533	1939 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PFAS	O15067	1338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KDM4A	O75164	1064 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	NDUFB10	O96000	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CHGB	P05060	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ERCC3	P19447	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CYP2B6	P20813	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PTPRE	P23469	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GNAQ	P50148	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	JAG1	P78504	1218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	WTAP	Q15007	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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