RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1A1	P14550	325 aa		20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKS1A	Q92625	1134 aa		20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF15	Q99988	308 aa		20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		20.33	■□□□□ 0.85
HDAC10-216	ENST00000489424	RARB	P10826	455 aa		20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCA1	Q86XH1	822 aa		20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		20.32	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	ICAM1	P05362	532 aa		20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	CASC1	Q6TDU7	716 aa		20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF180	Q86T96	592 aa		20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT23	Q9C075	422 aa		20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		20.31	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX17	Q15036	470 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC41	Q15345	812 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD1	Q719H9	257 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		20.3	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB14	A6NK59	587 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	PDHB	P11177	359 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	HAND2	P61296	217 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX3-2	P78367	333 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF146	Q9NTX7	359 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF24	Q9UPV7	400 aa		20.29	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEB2	H3BUK9	544 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF543	Q08ER8	600 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	ACVR2B	Q13705	512 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		20.28	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC96	Q2M329	555 aa		20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	FGD4	Q96M96	766 aa		20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
HDAC10-216	ENST00000489424	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CHML	P26374	656 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR153	Q6NV75	609 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS22	Q8NE09	1264 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MORC4	Q8TE76	937 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	NEDD4	P46934	1319 aa		20.26	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS4	O75173	837 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ALAS1	P13196	640 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMCX2	Q7L311	632 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SPC25	Q9HBM1	224 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM4A	O75164	1064 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A3	P48751	1232 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA1	Q8ND90	353 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	TOX2	Q96NM4	488 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9Y3F1	56 aa		20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA9	P57773	515 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	RTP1	P59025	263 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	KATNBL1	Q9H079	304 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT14	Q9H8E8	782 aa		20.23	■□□□□ 0.83

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