RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 AKR1B1P15121 316 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SLC4A3P48751 1232 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 BEX3Q00994 111 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 POLA2Q14181 598 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SCLYQ96I15 445 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.94■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TRANK1O15050 2925 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 MS4A1P11836 297 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ITGA7Q13683 1181 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 REPS2Q8NFH8 660 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SSH3Q8TE77 659 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CRBNQ96SW2 442 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 GOPCQ9HD26 462 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CD320Q9NPF0 282 aa18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CABYRO75952 493 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CYP2D6P10635 497 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ATP8B2P98198 1209 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TTLL4Q14679 1199 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.92■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CTAGE5O15320 804 aa18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 B4GALT4O60513 344 aa18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 PFKMP08237 780 aa18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ARMCX2Q7L311 632 aa18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.91■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ACTN1P12814 892 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 NHLH1Q02575 133 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 TAP1Q03518 808 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB128Q7Z7B8 93 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC17Q96LX7 622 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 RIPK3Q9Y572 518 aa18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SRPRB-204ENST00000484684 KIF28PB7ZC32 967 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ZEB2O60315 1214 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 TNFAIP2Q03169 654 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 GRB10Q13322 594 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 GJD3Q8N144 294 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 SLC9A7Q96T83 725 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 MYH8P13535 1937 aa18.89■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 NKX3-2P78367 333 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 TLK2Q86UE8 772 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 CPXCR1Q8N123 301 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.88■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 GRIN2DO15399 1336 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ALADP13716 330 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 PSMC6P62333 389 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 VWCEQ96DN2 955 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.87■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ASTN1O14525 1302 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ZBED4O75132 1171 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF15O94989 841 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 FGD4Q96M96 766 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 FBXL18Q96ME1 805 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 FBXO40Q9UH90 709 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 MCM3APO60318 1980 aa18.86■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 PDE6AP16499 860 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 CDK8P49336 464 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 LCORLQ8N3X6 602 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 KATNBL1Q9H079 304 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 KCNH6Q9H252 994 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.85■□□□□ 0.61
SRPRB-204ENST00000484684 MYH7P12883 1935 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms