RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 MEIS3Q99687 375 aa8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 SPC25Q9HBM1 224 aa8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 TECTAO75443 2155 aa8.79□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 DCXO43602 365 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 CABYRO75952 493 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 COPB2P35606 906 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 CERS3Q8IU89 383 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 RIPK3Q9Y572 518 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 PTPRSQ13332 1948 aa8.78□□□□□ -1
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 FOXK2Q01167 660 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS33Q8NF86 280 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 MRS2Q9HD23 443 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 GPR108Q9NPR9 543 aa8.77□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 LCHNA4D1U4 455 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 AKR1B1P15121 316 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 KCNA5P22460 613 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PTGS1P23219 599 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ICA1Q05084 483 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ARMCX2Q7L311 632 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 NEK9Q8TD19 979 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 DDX11Q96FC9 970 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 KIF28PB7ZC32 967 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 CYP2C9P11712 490 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ACTN1P12814 892 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PSMC6P62333 389 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TNFAIP2Q03169 654 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ZP2Q05996 745 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TNNI3KQ59H18 835 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SH2D4AQ9H788 454 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ATP2A1O14983 1001 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 CYP2D6P10635 497 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 RFC2P35250 354 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TCF15Q12870 199 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 IER5LQ5T953 404 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TLK2Q86UE8 772 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SWAP70Q9UH65 585 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 MYO7AQ13402 2215 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF536O15090 1300 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 TNKSO95271 1327 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 FAM186AA6NE01 2351 aa8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 BAIAP3O94812 1187 aa8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 GNAI3P08754 354 aa8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 IQCF3P0C7M6 154 aa8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.73□□□□□ -1.01
CASQ1-203ENST00000481081 SMPD1P17405 629 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms