RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478378.5

TIMM17A-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17A, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-202ENST00000478378 CFAP54Q96N23 3096 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 ADCY6O43306 1168 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 GPR37L1O60883 481 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CABYRO75952 493 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CA3P07451 260 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CYP2D6P10635 497 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CCL23P55773 120 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 REPS2Q8NFH8 660 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 C5orf42Q9H799 3197 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 PFKMP08237 780 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 PDE6AP16499 860 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC4A3P48751 1232 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 BEX3Q00994 111 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 ARMCX2Q7L311 632 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 LCORLQ8N3X6 602 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SSH3Q8TE77 659 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 HLA-CQ95604 372 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC17Q96LX7 622 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TIMM17A-202ENST00000478378 CACNA1HO95180 2353 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 RFXAPO00287 272 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 CTAGE5O15320 804 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TLL1O43897 1013 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ZEB2O60315 1214 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 B4GALT4O60513 344 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ACTN1P12814 892 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TRIM27P14373 513 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ITGA7Q13683 1181 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 KRT40Q6A162 431 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TLK2Q86UE8 772 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 AACSQ86V21 672 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 SCLYQ96I15 445 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC9A7Q96T83 725 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 CERS4Q9HA82 394 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 FBXO40Q9UH90 709 aa8.08□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 MYO7AQ13402 2215 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 EPOPA6NHQ4 379 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 PRR33A8MZF0 331 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 SMIM22K7EJ46 135 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ATP2A1O14983 1001 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ZBED4O75132 1171 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 BCAR3O75815 825 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 CDK8P49336 464 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 NKX3-2P78367 333 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TNFAIP2Q03169 654 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 TTLL4Q14679 1199 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 CPXCR1Q8N123 301 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 11.2
TIMM17A-202ENST00000478378 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 FGD4Q96M96 766 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ARMT1Q9H993 441 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 RIPK3Q9Y572 518 aa8.07□□□□□ -1.12
TIMM17A-202ENST00000478378 USP34Q70CQ2 3546 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms