RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 GMCL1Q96IK5 515 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 POTEB2H3BUK9 544 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDE1AP54750 535 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 SNAP25P60880 206 aa28.15■■■□□ 2.1
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ARMCX2Q7L311 632 aa28.15■■■□□ 2.1
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPC25Q9HBM1 224 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 RNF146Q9NTX7 359 aa28.15■■■□□ 2.1
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ALAS1P13196 640 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 RAG1P15918 1043 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 CNTN2Q02246 1040 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNA10Q16322 511 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC96Q2M329 555 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.13■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM227BQ96M60 508 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 MCM3APO60318 1980 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYADML2A6NDP7 307 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.12■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 RILPL2Q969X0 211 aa28.11■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 A0A0D9SFI3 127 aa28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.1■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ITGB8P26012 769 aa28.09■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 GNASQ5JWF2 1037 aa28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.09■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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PRKRIP1-205ENST00000477886 KIAA0355O15063 1070 aa28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 ORC4O43929 436 aa28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLA2G6O60733 806 aa28.07■■■□□ 2.08
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PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.07■■■□□ 2.08
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PRKRIP1-205ENST00000477886 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.06■■■□□ 2.08
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PRKRIP1-205ENST00000477886 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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PRKRIP1-205ENST00000477886 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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PRKRIP1-205ENST00000477886 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 TTBK2Q6IQ55 1244 aa28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOX2Q96NM4 488 aa28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 GUCD1Q96NT3 240 aa28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 ELP1O95163 1332 aa28.04■■■□□ 2.08
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