RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 CUEDC2Q9H467 287 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF536O15090 1300 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 FIBPO43427 364 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 TKFCQ3LXA3 575 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 NR1I2O75469 434 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 KANK3Q6NY19 840 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 KCNN1Q92952 543 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 ADCY7P51828 1080 aa7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC96Q2M329 555 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TCP10Q12799 353 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CUL5Q93034 780 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 AMNQ9BXJ7 453 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 ICAM1P05362 532 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 BCRP11274 1271 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 PTPRAP18433 802 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 STAT2P52630 851 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 NLRP5P59047 1200 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SARM1Q6SZW1 724 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CLRN2A0PK11 232 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 NDUFA8P51970 172 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.36□□□□□ -1.23
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