RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476590.1

CD55-208, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), human

TSL 1 (best)

Gene CD55, Length 2,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD55-208	ENST00000476590	CCT8	P50990	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DMPK	Q09013	629 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SYNM	O15061	1565 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CUX1	P39880	1505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	IL4R	P24394	825 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HOXD12	P35452	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RBL2	Q08999	1139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	INA	Q16352	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	USP47	Q96K76	1375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	BECN2	A8MW95	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	STXBP3	O00186	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NDUFB5	O43674	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MAN1A2	O60476	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TGFB3	P10600	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	OSBP	P22059	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MLH1	P40692	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MXRA7	P84157	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MAP7	Q14244	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CASP8	Q14790	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms