RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469147.5

TRAPPC12-215, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 1,002 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC25A27	O95847	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KIF5B	P33176	963 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FGD1	P98174	961 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	IRF5	Q13568	498 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GRM4	Q14833	912 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CYP2B6	P20813	491 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GNAQ	P50148	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CCL14	Q16627	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62	2e-8	■■■■□ 22.3
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MROH8	Q9H579	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	HMGCR	P04035	888 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	STAT3	P40763	770 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	EVC	P57679	992 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147		Q6ZUG5	572 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	USP6NL	Q92738	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NID2	Q14112	1375 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZBTB43	O43298	467 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	STRN	O43815	780 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ICAM1	P05362	532 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CPA1	P15085	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC16A2	P36021	539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PLS1	Q14651	629 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GPR142	Q7Z601	462 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TRIB2	Q92519	343 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BRF1	Q92994	677 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAPPC12-215	ENST00000469147	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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